Description de poste
Date de début de publication:  24/02/2025
ID de l'offre:  639
Unit:  Vegetable Seeds Traits and Technology
Titre du poste:  Bioinformatics Engineer (H/F)
Localisation:  Loire-Authion
Type de contrat:  CDD
Description de poste: 

CDD 6 mois - Développeur(se) en bioinformatique

À propos du poste

 

Vous êtes passionné(e) par la bioinformatique et le développement de bases de données ? Vous souhaitez contribuer à un projet innovant dans l’analyse de séquences génomiques de pathogènes ? Rejoignez notre équipe de bioinformatique en tant que Développeur(se) en Bioinformatique !

Dans ce rôle, vous serez en charge du développement d’une base de données dédiée à l’hébergement et à la gestion des séquences génomiques de pathogènes, ainsi que de leurs métadonnées (date et lieu des prélèvements, type de pathogène, phylogénie, etc.). Vous travaillerez en étroite collaboration avec nos bioinformaticiens et les utilisateurs finaux pour garantir une solution optimisée et répondant aux besoins métiers.

Vos Missions

 

  • Concevoir et développer une base de données performante pour l’hébergement et la gestion des séquences génomiques et leurs métadonnées.
  • Développer et implémenter les API permettant d’interfacer la base de données avec nos outils internes (notamment Galaxy et Shiny).
  • Optimiser l’architecture et l’accessibilité des données en proposant des solutions innovantes.
  • Collaborer avec les bioinformaticiens et les utilisateurs finaux pour recueillir et analyser les besoins fonctionnels et techniques.
  • Participer à l’intégration des données et à la formation des utilisateurs pour assurer une adoption optimale de la solution.

Ce que nous attendons de vous

 

Formation : Master 2 ou équivalent en bioinformatique.
Expérience : Une expérience en développement de bases de données biologiques est fortement recommandée.
Compétences techniques requises :

  • Maîtrise des bases de données MySQL, PostgreSQL et/ou MongoDB.
  • Connaissances en génomique.
  • Bonne maîtrise de l’environnement Linux.
  • Un plus : Connaissance des outils Galaxy et Shiny.

Quelques éléments de contexte

 

Quatrième semencier mondial, Limagrain est un groupe coopératif international créé et dirigé par des agriculteurs français. Créateur et producteur de variétés végétales, Limagrain commercialise des semences de grandes cultures, des semences potagères et des produits céréaliers.

HM.CLAUSE, Business Unit du Groupe Limagrain, est un leader mondial innovant dans le développement, la production et la commercialisation de semences potagères. HM.CLAUSE fait partie des cinq premières entreprises de semences potagères dans le monde. Avec plus de 2000 variétés dans plus de 20 cultures potagères, HM.CLAUSE fournit des solutions innovantes aux producteurs à travers le monde.

Vous vous retrouvez dans cette offre ?

 

Postulez sans attendre - nous cherchons à pourvoir ce poste dès le mois de mars !

Localisation - Loire Authion, France.
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Limagrain est le leader mondial des semences potagères et opère sur le marché avec 3 Business Units : HM.CLAUSE, Vilmorin-Mikado et Hazera. Limagrain Vegetable Seeds a développé un portefeuille de produits comprenant plus de 40 espèces, et opère sur tous les continents. Le fort investissement dans les technologies et le développement, la proximité avec les clients, la culture des partenariats permettent à Limagrain Vegetable Seeds de fournir aux producteurs de légumes du monde entier des semences efficaces adaptées aux besoins de chaque région.

Limagrain est une coopérative agricole et un groupe semencier international détenus par 1 300 agriculteurs installés dans le Puy-de-Dôme en Auvergne. Présent dans 49 pays et rassemblant 9 335 collaborateurs, le Groupe sélectionne, produit et commercialise des semences de grandes cultures, des semences potagères et des produits agroalimentaires. Focalisé sur le progrès génétique des plantes, Limagrain est le quatrième semencier mondial.
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