Finalité du poste
Intégré(e) au Centre de Recherche de Chappes de Limagrain Europe, vous rejoindrez l’équipe Applied Genomics Platform (département Traits & Technologies).
Vous participerez au développement et à l’optimisation d’un pipeline expérimental et analytique visant à accroître la recombinaison chromosomique dans des régions introgressées et à produire des lignées donneuses à plus forte valeur ajoutée pour la sélection.
Vos Missions
Le/la stagiaire aura pour principales responsabilités :
- Réaliser une revue bibliographique approfondie sur les mécanismes de contrôle de la recombinaison chromosomique et leurs applications en amélioration du blé.
- Poursuivre des programmes de croisements initiés en amont du stage, assurer la fixation et la caractérisation des recombinants, et piloter leur retour vers la lignée récurrente.
- Mettre en œuvre des analyses de génotypage (puces, KASP, etc…) ou séquençage pour détecter et interpréter les potentielles anomalies chromosomiques pouvant être induites, avec un appui éventuel en cytogénétique en partenariat avec une structure académique.
- Effectuer un screening à grande échelle (≈1500 plantes) sur un lot issu de croisements existants pour identifier des recombinaisons d’intérêt et évaluer l’efficacité du dispositif en fonction de la région du génome et la distance génétique entre Triticum aestivum et le donneur exotique.
- Initier de nouveaux croisements ciblant des caractères majeurs provenant d’introgressions exotiques, développer des marqueurs moléculaires spécifiques et assurer leur génotypage au sein du laboratoire.
- Participer au transfert et à la validation du système expérimental facilitant la recombinaison dans un fond génétique Elite de type blé d’hiver.
- Contribuer à l’optimisation du pipeline complet, incluant l’évaluation des efforts et du coût de production associés à la création d’un donneur optimisé.
Quelques éléments de contexte
Limagrain Europe est une Business Unit de Limagrain, spécialisée dans les semences de grandes cultures à l’échelle européenne. Quatrième semencier mondial, Limagrain est un groupe coopératif agricole international porté par l’innovation et la recherche appliquée.
Dans le cadre des programmes d’amélioration du blé tendre (Triticum aestivum), l’introduction de gènes d’intérêt issus d’espèces apparentées constitue un levier essentiel pour enrichir la diversité génétique et répondre aux enjeux agronomiques (résistance aux maladies, tolérance au stress, qualité technologique…). Cependant, la taille importante des fragments introgressés peut induire des effets indésirables sur la performance variétale.
Le projet vise à optimiser un système de régulation de la recombinaison chromosomique permettant de réduire la taille des introgressions exotiques tout en conservant les gènes d’intérêt, ouvrant la voie à de nouveaux outils génétiques pour la sélection.
Ce que nous attendons de vous
- Étudiant(e) en Master 2 ou école d’ingénieur avec spécialisation en biologie végétale, génomique, biologie moléculaire, amélioration des plantes ou domaines apparentés.
- Bonnes connaissances en génétique et biologie moléculaire. Des compétences en génotypage, cytogénétique ou bio-informatique seraient un atout.
- Rigueur scientifique, goût pour l’expérimentation, curiosité et intérêt pour l’innovation en sélection végétale.
- Bon esprit d’équipe, autonomie, aptitudes rédactionnelles et bonnes capacités de communication.
- Maîtrise de l’anglais scientifique.
Compétences
Informations pratiques
- Durée : 6 à 7 mois, à partir de janvier 2025
- Lieu : Centre de Recherche Limagrain Europe, Chappes (63) – à proximité de Clermont-Ferrand
- Encadrement : Chef de projet Céréales et Tournesol, équipe Applied Genomics Platform
- Gratification : selon la réglementation en vigueur
- Avantages : accès au restaurant d’entreprise
Process de recrutement
Les candidats sont invités à transmettre un CV et une lettre de motivation. Après une première sélection, un entretien sera organisé avec les RH et le tuteur de stage (par Teams ou en présentiel). Une réponse finale sera communiquée rapidement après la phase d’entretiens.